Steven Hanes博士
LANGUAGES
研究项目和附属机构
研究兴趣
EDUCATION
研究抽象
先前的研究
发育与疾病中的基因调控我的实验室对细胞在胚胎早期发育和细胞周期中如何控制基因活动感兴趣. 调控的一个关键点是单个基因的RNA拷贝的合成. 这个过程是由RNA聚合酶II (RNA pol II)完成的。. 我们在两种不同的背景下研究RNA pol II(见下文). 我们的发现与理解发生在人类细胞中的类似机制有关, 它的破坏通常与疾病有关.
同源框基因一个项目研究了同源盒转录调控因子 黑腹果蝇 (fruit fly). 例如,同型盒基因叫做 bicoid 指导早期胚胎头部和胸部的发育. Bicoid的工作原理是将RNA pol II招募到选定的靶基因上, 它究竟是如何做到这一点的,是我们研究的主题. 我们的研究结果对于理解同型盒基因如何在正常细胞中起作用以及它们的破坏如何导致某些人类癌症具有重要意义.g. 儿童白血病). 我们还发现了与Bicoid相互作用的蛋白质(Sap18和Bin3). 这些蛋白质在人体中也有对应的蛋白质,我们正试图了解它们是如何起作用的.
Prolyl异构酶第二个项目涉及一种名为 ESS1 in 酿酒酵母 (酵母),它编码一种被称为脯氨酸异构酶的酶. ESS1 是酵母和细胞生长所必需的吗 ESS1 有丝分裂阻滞. 的对应物 ESS1 在人体中发现的,叫做 PIN1. 我们发现Ess1通过控制RNA pol II的构象起作用. 这种认识可能会导致抗真菌药物的发展(见下文)。. 为了这个目标,我们孤立了 ESS1 from 白色念珠菌 and 新型隐球菌两种主要的人类真菌病原体. 在这些生物体中,Ess1对毒力很重要, 因此,我们正朝着最终目标努力,以抑制Ess1作为潜在的抗真菌治疗方法.
目前的研究
抗真菌药物开发由于出现对现有抗真菌药物具有耐药性的致病性真菌,危及生命的真菌感染在世界范围内正在增加, 免疫抑制疗法的使用增加以及人口老龄化. 我们正在与业界合作开发新颖、安全、广谱的治疗方法.
阶段分离和对极端环境的进化适应相分离是一种生物物理过程,可能被生物体用来在极端环境中生存. 我们提出,进化力量作用于蛋白质,以调整相分离(集中生物分子),以应对极端温度和其他具有挑战性的环境条件. 这些知识将帮助我们了解微生物在其他不适宜生存的条件下(如南极洲)存活的机制。, 并且可能为如何在寒冷中保存组织提供潜在的见解.
选择引用:
- Palumbo, R. J., Yang, Y., Feigon, J.哈内斯,S. (2024). Bin3/MePCE甲基转移酶结构域的催化活性对于7SK snRNP功能是必不可少的 黑腹果蝇. Genetics, 1月3日DOI: 10.1093/遗传学/iyad203, PMCID: PMC10763541
- Palumbo, R. J., McKean, N.莱瑟曼,E., Namitz, K. E. W,康奈尔,L., Wolfe, A., Moody, K.gostinar, C.纽约州冈德-西曼尔曼., Bah, A.哈内斯,S. D. (2022). 极性真菌Ess1-CTD轴的共同进化表明相分离在耐寒性中的作用. 科学的进步 Vol 8,第36期,eabq3235, 9月7日 DOI: 10.1126/sciadv.abq3235
- Namitz, K. E. W. , Zheng, T.坎宁,A. J.艾丽西亚-委拉斯开兹,n.n. L., Castañeda, C. A. 和M .科斯格罗夫. C.哈内斯,S. D. (2021)结构分析表明,Ess1通过二价锚定机制使RNA聚合酶II的羧基端结构域异构化. Nat. Comms Biol. 4:398 http://doi.org/10.1038/s42003-021-01906-8
- Hanes, S. D. (2015). 基因转录中的脯氨酸异构酶. (Review) 工商管理学士通识科目 (开放获取,10月10日在线发布. 31, 2014).
- Allepuz-Fuster P.马丁内斯-费尔南德斯,V. Garrido-Godino,.我,阿隆索-阿奎多,S. Hanes, S.D.纳瓦罗,F. 卡尔沃,O. (2014). Rpb4/7促进RNA聚合酶II CTD去磷酸化. Nuc. Acids Res. 42: 13674-88.
- Hanes, S. D. (2014). Ess1脯氨酸异构酶:RNA聚合酶II转录周期的交通警察. (Review) BBA基因调控机制 1839: 316-333.
- Atencio, D.巴恩斯,C., Duncan, T. M., Willis, I. M,和S. D. (2014). 酵母Ess1脯氨酸异构酶控制Swi6和wh5的核定位. 基因,基因组,遗传学 4: 523-537.
- Samaranayake D.D . Atencio., Morse, R., Wade, J.T.查图维迪,V.哈内斯,S.D. (2013). Ess1在植物生长、形态发生转换和RNA聚合酶II转录中的作用 白色念珠菌. PLoS ONE[j] .浙江农业学报,2014,8(3):59094.
- Ma, Z.D.巴恩斯,C.DeFiglio, H.哈内斯,S. D. (2012) Ess1脯氨酸异构酶在RNA聚合酶II转录周期中的多重作用. Mol. Cell. Biol. 32: 3594-3607.
- Cosgrove, M., Ding, Y., Rennie, W. A., Lane, M. J.哈内斯,S. D. (2012). Bin3 RNA甲基转移酶(MePCE)靶向7SK RNA控制转录和翻译. WIRES-RNA (回顾)(Wiley) 7月12日,PMID:22740346
- 《,. R.杰罗尼莫,C.雅克·p·e.拉里米,L.福廷,M-E.森林,A.Bergeron, M., Hanes, S. D.罗伯特,F. (2012). 一个通用的RNA聚合酶II CTD周期是由激酶之间复杂的相互作用精心安排的, phosphatase, 以及基因上的异构酶. Mol. Cell 45: 158-170.
- Samaranayake D. P.哈内斯,S. D. (2011). 里程碑 白色念珠菌 基因操作. (Review) 真菌麝猫 & Biol. 48: 858-865.
- Singh, N.莫洛克. 哈内斯,S. D. (2011). Bin3 RNA甲基转移酶是 caudal 政府的镇压 Drosophila embryo. Devel. Biol. 352: 104-115.
- Singh, N., Ma, Z.吉米尔,T., Wu, X.罗塞蒂尼,A.拉贝勒,C., Beane, O.DeFiglio, H.帕伦坡,M., Morse, R. 哈内斯,S.D. (2009). Ess1脯氨酸异构酶是通过Nrd1途径终止小的非编码调控rna的转录所必需的. Mol. Cell, 36: 255-266.
- Li, Z., Li, H-M.Devasahayam G.吉米尔,T.查图维迪,V., Hanes, S. D.Van Roey, P. (2005). 结构 白色念珠菌 Ess1脯氨酸异构酶揭示了一个限制结构域迁移的有序连接区域. 生物化学 44: 6180-6189.
- Singh, N., Zhu, W. 哈内斯,S. D. (2005). Sap18 是母体基因所必需的 bicoid 引导向前的模式 黑腹果蝇. Devel. Biol. 278; 242-254.
- Lebrecht, D., Foehr, M., Smith, E., Lopes, F. J. P.Vanario-Alonso C. E.赖尼茨,J., Burz, D. S.哈内斯,S. D. (2005). 双曲面DNA合作结合对胚胎模式发育至关重要 Drosophila. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 102: 13176-13181.
- Wu, X.罗塞蒂尼,A. 哈内斯,S. D. (2003). The ESS1 脯氨酸异构酶及其抑制因子 BYE1 与RNA pol II相互作用抑制转录伸长 酿酒酵母. Genetics 165: 1687-1702.
- Devasahayam G.查图维迪,V. 哈内斯,S. D., (2002). Ess1脯氨酸异构酶是水稻生长和形态发生转换所必需的 白色念珠菌. Genetics 160: 37-48.
- Zhu, W., Foehr, M., Jaynes, J. B.哈内斯,S. D. (2001). Drosophila SAP18, Sin3/Rpd3组蛋白去乙酰化酶复合体的一个成员与Bicoid相互作用并抑制其活性. Dev. Genes Evol. 211: 109 – 117.
- Burz, D. S. 哈内斯,S. D. (2001). 分离破坏协同DNA结合的突变 Drosophila Bicoid蛋白质. J. Mol. Biol. 305: 219-230.
- Wu, X., Wilcox, C. B.Devasahayam G.哈克特,R.L.阿雷瓦洛-罗德里格斯,M.卡德纳斯,M.海特曼,J.哈内斯,S. D. (2000). Ess1脯氨酸异构酶与染色质重塑复合体和一般转录机制有关. EMBO J. 19: 3727-3738. (选择在“编辑选择”部分, Science, 289:833)
- Burz, D.S.R . Rivera-Pomar., Jackle, H.哈内斯,S.D. (1998). Bicoid的协同DNA结合提供了一种阈值依赖性激活机制 Drosophila embryo. EMBO J. 17: 5998-6009.
- Lu, K. P., Hanes, S. D.亨特,T. (1996). 有丝分裂调节所必需的人多肽-脯氨酸异构酶. Nature 380: 544-547.